AKC的治疗包括基础眼部护理和局部用药，有时需要全身性用药。

通常使用双重作用药物开始治疗，即同时具有肥大细胞稳定作用和抗组胺作用的药物。若症状未充分改善，则下一步给予短疗程局部用皮质类固醇。对于局部用皮质类固醇减量时症状难以控制的患者，可加用局部用钙调磷酸酶抑制剂作为激素助减剂。随着时间推移，大多数患者在接受这些措施后症状能得到充分控制，但小部分患者需要全身性免疫抑制治疗。

抗组胺药/肥大细胞稳定剂：使用有肥大细胞稳定作用的局部用抗组胺药时，根据其对其他过敏性眼病的疗效，通常应每日用药，作为长期预防性治疗。稳定肥大细胞可防止眼组织中的肥大细胞释放组胺和其他促炎介质。常见的副作用包括滴药时刺痛和烧灼感，冷藏滴眼液和/或在使用这些药物前使用冷藏过的人工泪液会有所帮助。其他不良反应包括头痛和眼干加重。

局部用皮质类固醇：对于肥大细胞稳定剂/抗组胺药持续治疗2周或3周无反应的患者，可给予局部用皮质类固醇冲击治疗。局部用皮质类固醇用于控制炎症，因而肥大细胞稳定剂/抗组胺药和人工泪液有更大的机会发挥作用。需要注意的是，该治疗需要密切监测患者并且只能短期应用。长期局部用皮质类固醇会增加白内障形成、青光眼和严重眼部感染（如疱疹性角膜炎）的风险。

局部用钙调磷酸酶抑制剂：局部用钙调磷酸酶抑制剂也用于难治性症状。此类药物的优势是不会升高眼压，不良反应包括刺痛和眼睑浸渍。

全身用免疫抑制剂：对于局部用皮质类固醇无效或需要使用6周以上的严重病例，有时应用全身性免疫抑制剂，如泼尼松、环孢素或他克莫司。对于这些疑难病例，推荐由眼科医师、内科医师、变态反应专科医师、皮肤科医师和/或风湿科医师共同进行治疗，以使结局最佳以及副作用最少。

此外，AKC的治疗也包括治疗眼睑皮炎。首选局部用钙调磷酸酶抑制剂，如局部用他克莫司（1%）和吡美莫司（1%）软膏，因为这些药物长期副作用更少。对于难治性症状，也可选择低效价局部用皮质类固醇软膏，如氟米龙或氯替泼诺。这些药物可涂于眼睑（一日2-4次，持续数周）来治疗发炎的眼周皮肤。然而，应提醒患者长期使用皮质类固醇于皮肤可导致真皮变薄。此外，由于皮质类固醇的皮肤渗透性，应监测这些患者的眼部副作用。