眼部有活动性炎性病变，如角膜溃疡、角膜感染、眼内感染、急性角结膜炎等，也不适合做手术。

患有青光眼的人能不能做近视眼手术呢？实际上这个要看情况。青光眼本身并非近视眼手术的禁忌。不过处在进展期的青光眼患者，眼压检测很重要，如果做完近视眼手术，角膜变薄，用常规的喷气式眼压计测量得出的数值可能要比实际低，干扰青光眼医生的判断。但只要患者告知青光眼医生，误差的问题也可以避免。

一些全身性疾病，比如未受控的糖尿病、全身结缔组织病（包括红斑狼疮、类风湿关节炎、硬皮病、皮肌炎、结节性多动脉炎、干燥综合征等）及严重自身免疫性疾病等，都不适合做近视手术。抑郁症等精神疾病患者也不适合做近视眼手术。另外，瘢痕体质的人由于伤口愈合较慢，在切削角膜后，角膜也较易形成不规则或瘢痕愈合，因此不适合做准分子激光手术，但可以做半飞秒、全飞秒激光手术。