由于眼药水中大多含有防腐剂，会使眼睛中的结膜杯状细胞发生损伤。如结膜杯状细胞受损的话，人就会患上干眼症，眼睛发红、干涩或者疼痛，这样会导致越点眼药水，眼睛越干疼。

眼药水根据治疗功效，分为很多种类，如抗生素类、抗病毒类、激素类等，使用不当就会对人造成损害。例如激素类眼药水，如果使用过多的话，会使人在不知不觉中患上激素性青光眼，导致人视力下降，视觉和视野受到损伤。这种损伤不可逆，基本没有好转的可能。另外，抗生素类眼药水只能用于眼睛有感染的情形，没有感染时使用，只会对眼睛造成损害。